Pokémon Mystery Dungeon: Explorers of Time i Pokémon Mystery Dungeon: Explorers of Darkness to sequele poprzednich części, tym razem wydane jedynie na platformę Nintendo DS. Obejmują one nowe, Pokemony IV generacji, opcję Wi-Fi oraz, użycie dotykowego ekranu.

Rozpoczynając grę wypełniamy test, zadecyduje on, jakim Pokemon będziemy grać oraz będziemy posiadać opcję wybrania sobie Pokemona-partnera.

Historia zaczyna się, gdy gracz jest wyrzucony na brzeg przez burzę. Tymczasem, nad partner wystepuje do gildii Wigglutuffa. Spaceruje po brzegu plaży, gdzie spotyka naszego bohatera i informuje go, że został przekształcony w Pokemona... Japoński tytuł: Pokémon Fushigi no Dungeon: Yami no Tankentai, Pokémon Fushigi no Dungeon: Toki no Tankentai
Angielski tytuł: Pokémon Mystery Dungeon Time Expedition, Pokémon Mystery Dungeon Darkness Expedition
Premiera:
Japonia - 13 września 2007 r.
Ameryka Północna - 20 kwietnia 2008 r.
Europa - 4 lipca 2008 r.
Platforma: Nintendo DS
Gatunek: Role-playing (RPG) / Dungeon Crawler
Przedział wiekowy: brak ograniczeń
Wydawca: Nintendo